El Consejo Directivo del CODOPESCA esta integrado por las siguientes entidades:
- Ministerio de Agricultura, quien lo preside
- Ministerio de Medio Ambiente y Recursos Naturales;
- Instituto Dominicano de Investigación Agropecuaria y Forestales;
- Armada de Republica Dominicana;
- Bagrícola;
- El Instituto de Estabilización de Precios;
- Instituto de Desarrollo y Crédito Cooperativo;
- El Instituto Superior de Agricultura;
- El Centro de Investigación y Mejoramiento de la Producción Animal.
- El Consejo Nacional de Producción Pecuaria;
- Un Representante de las Empresas Pesqueras;
- Un Representante de la Asociación de Acuicultores;
- Un Representante de la Asociación de Pescadores;
- El Director Ejecutivo de CODOPESCA, quien fungirá como Secretario del Consejo con voz pero sin voto;